明嘉靖皇帝欲登仙界，整日祈求长生不老。他受道士王金、申世恩、花非花之骗，降旨要在仙人巷修建灵坛一座，供养女姑花非花奉献的"灵芝仙草"。为建灵坛，工部主事顾造及道士率众锦衣卫强拆民房，搞得黎民百姓惶恐不安。户部主事海瑞巡视民情时，目睹奸臣掠夺民财，他挺身而出伸张正义。梁材奉首辅大臣徐阶之命督察修建灵坛之事，与海瑞相遇，二人同慨百姓的疾苦，共诉嘉靖昏庸无道。来到仙人巷，梁材一眼识破道士、道姑乃是他三年前曾追捕过的三个贼人。梁材很是气愤，欲揭穿他们的诡计。假道士唯恐真面目被揭露，策划谋杀海瑞未遂，罪恶的魔掌又伸向梁材。此时国家外有倭寇进犯，内有朝廷腐败，危机四伏，民不聊生。梁材只因上朝劝谏，一言触犯假道士，被廷仗六十，边外充军……秉性刚直、一身浩然正气的海瑞欲为国分忧，但苦于自己六品小官无法上朝劝谏。