《扑通扑通花少年》的故事围绕高瀚宇饰演的花千肉展开，这位美少年天生身带异香，并将自己的这一特质融入祖传绝技——蒸包子中，得到街坊邻居的疯狂追捧。然而由于在20岁之前还没有找到真爱，少年体味儿突然变淡，包子生意岌岌可危。父母赶紧安排相亲，使花千肉心烦意乱，决意离家出走。途中，他结识了任性傲娇的千金小姐白子蝎（吴桐饰）、斯文“海归”乌太贤（王修泽饰）、奇葩绑架犯一刀煞（张宁浩饰）、温柔帅气型男盐宝（蒋一铭饰）。他们喜笑怒骂，发生了一系列令人啼笑皆非的故事，而在这过程中，几人也各自找到了真爱。